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本發(fā)明公開(kāi)了一種黃牛TAS1R2基因的單核苷酸多態(tài)性及其檢測(cè)方法，其基因單核苷酸多態(tài)性包括：以包含TAS1R2基因的待測(cè)黃牛全基因組DNA為模板，以引物對(duì)P為引物，PCR擴(kuò)增黃牛TAS1R2基因；對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行變性后，再對(duì)變性后的擴(kuò)增片段進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳；根據(jù)電泳結(jié)果鑒定黃牛TAS1R2基因第288bp的堿基多態(tài)性。該方法是一種在DNA水平上篩查和檢測(cè)與黃牛產(chǎn)肉性狀密切相關(guān)的分子遺傳標(biāo)記，以用于黃牛的輔助選擇和分子育種，加快黃牛良種繁育速度

南京郵電大學(xué)理學(xué)院曾紅麗副教授與合作者在新型冠狀病毒SARS-CoV-2基因序列分析方面取得重要進(jìn)展，預(yù)測(cè)了該病毒在自然選擇過(guò)程中的適應(yīng)性，指出并分析了該病毒在演化過(guò)程中存在的弱點(diǎn)，分析了相應(yīng)綜合醫(yī)藥開(kāi)發(fā)應(yīng)注意的關(guān)鍵基因位點(diǎn)。該成果以南京郵電大學(xué)為第一完成單位，于2020年11月17日在線發(fā)表于國(guó)際權(quán)威期刊美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊（PNAS）上。 COVID-19疫情是由β-冠狀病毒SARS-CoV-2引起的全球性公共衛(wèi)生突發(fā)事件。各類數(shù)據(jù)庫(kù)搜集了大量的且不斷增加的高質(zhì)量全基因組序列。本工作利用這些序列，研究其是否顯示出病毒演化過(guò)程中上位性對(duì)適應(yīng)性的影響。在具有高重組率的種群演化中，本工作創(chuàng)新性地發(fā)展和應(yīng)用了統(tǒng)計(jì)物理學(xué)中的反Potts模型，來(lái)檢測(cè)自然選擇過(guò)程中的上位性影響。該工作為利用大量基因組序列來(lái)獲取具有高重組率的病原體在演化過(guò)程中的弱點(diǎn)開(kāi)辟了廣闊前景。 該研究工作最終將新型冠狀病毒的大約3萬(wàn)個(gè)基因位點(diǎn)濃縮為存在顯著相互影響的8對(duì)基因位點(diǎn)（ORF3a和nsp2，nsp12和nsp6，ORF8和nsp4，以及基因nsp2，nsp13和nsp14），為尋找病毒病原體結(jié)合和重組過(guò)程中存在的弱點(diǎn)帶來(lái)了希望，對(duì)開(kāi)發(fā)臨床治療的綜合靶向藥物、研究病毒進(jìn)入宿主后的發(fā)病機(jī)制有著很強(qiáng)的生物醫(yī)學(xué)指導(dǎo)意義。 和其他許多疾病一樣，針對(duì)COVID-19的潛在藥物靶標(biāo)的組合數(shù)量非常多。本研究工作不僅提供了哪些基因位點(diǎn)之間存在相互影響，并可以對(duì)其進(jìn)行排名，從而進(jìn)行更進(jìn)一步詳細(xì)研究。結(jié)合隨機(jī)性檢驗(yàn)，該研究工作最終預(yù)測(cè)了存在顯著上位性的8對(duì)基因位點(diǎn)中，有3對(duì)涉及到與新冠肺炎的重癥密切相關(guān)的病毒基因ORF3a。遺憾的是，目前關(guān)于針對(duì)ORF3a基因的臨床靶向藥物的報(bào)道還較為罕見(jiàn)，值得醫(yī)藥學(xué)研究人員在該方面加強(qiáng)研究。另外，本研究工作中預(yù)測(cè)的8對(duì)基因位點(diǎn)可作為實(shí)驗(yàn)生物學(xué)的原假設(shè)，以供生物學(xué)研究人員在此基礎(chǔ)上設(shè)置相關(guān)微生物實(shí)驗(yàn)，研究新冠病毒進(jìn)入人體后引起發(fā)病的機(jī)理。 此項(xiàng)研究工作由南京郵電大學(xué)與意大利的里雅斯特大學(xué)、古巴哈瓦那大學(xué)、瑞典哥德堡大學(xué)及瑞典皇家理工大學(xué)合作完成。曾紅麗副教授的研究工作受到國(guó)家自然科學(xué)基金委（基金號(hào)11705097）、江蘇省科學(xué)技術(shù)廳（基金號(hào)BK20170895）以及江蘇省政府留學(xué)獎(jiǎng)學(xué)金的大力支持。

本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及甘藍(lán)型油菜及其親本物種白菜和甘藍(lán)TT2基因家族及其應(yīng)用； 所述白菜透明種皮2的基因家族包括2個(gè)成員：BrTT2-l基因和BrTT2-2基因，所述甘藍(lán)TT2的基因家族的 1個(gè)成員BoTT2基因，所述甘藍(lán)型油菜TT2基因家族包括3個(gè)成員：BnTT2-l基因、BnTT2-2基因和BnTT2- 3基因；蕓菱屬6個(gè)TT2基因之間具有很高的同源性；本發(fā)明還公開(kāi)了上述基因家族在植物分子育種中的應(yīng) 用,通過(guò)反義抑制其在黑籽甘藍(lán)型油菜中的表達(dá)后,轉(zhuǎn)基因植株發(fā)生了種皮顏色變淺等性狀變化，具有創(chuàng)造 轉(zhuǎn)基因黃籽材料的潛力。

本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及甘藍(lán)型油菜及其親本物種白菜和甘藍(lán)MYBL2基因家族及其應(yīng) 用；所述白菜MYBL2基因家族包括2個(gè)成員：BrMYBL2-l基因和BrMYBL2-2基因，所述甘藍(lán)MYBL2基因家 族包括2個(gè)成員：B0MYBL2-1基因和BoMYBL2-2基因，所述甘藍(lán)型油菜MYBL2基因家族包括4個(gè)成員： BnMYBL2-l基因、BnMYBL2-2基因、BnMYBL2-3基因和BnMYBL2-4基因；蕓臺(tái)屬8個(gè)MYBL2基因之間具 有較高的同源性；本發(fā)明還公開(kāi)了上述基因家族在植物分子育種中的應(yīng)用，通過(guò)構(gòu)建正義超量表達(dá)植物載體，轉(zhuǎn)化黑籽甘藍(lán)型油菜品種中雙10號(hào)后，獲得6株轉(zhuǎn)基因植株。與非轉(zhuǎn)基因的外植體對(duì)照相比，轉(zhuǎn)基因植 株生長(zhǎng)發(fā)育正常，但種皮中原花青素等色素減少，同時(shí)種皮變薄，形成轉(zhuǎn)基因黃籽性狀，是油菜黃籽性狀育 種的新資源。

 三疣梭子蟹基因組圖譜     唐伯平供圖蝦蟹類基因組是公認(rèn)的高復(fù)雜基因組，要獲得高質(zhì)量的基因組有著很多困難。近日，由鹽城師范學(xué)院江蘇省鹽土生物資源研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授唐伯平課題組牽頭的中外合作團(tuán)隊(duì)，第一次獲得了我國(guó)重要淡水和海水經(jīng)濟(jì)蟹類中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的高質(zhì)量基因組圖譜，并分別在線發(fā)表于GigaScience和《遺傳學(xué)前沿》。三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是我國(guó)沿海大型的海洋經(jīng)濟(jì)蟹類，我國(guó)每年捕撈量在55萬(wàn)噸左右。唐伯平團(tuán)隊(duì)獲得的三疣梭子蟹基因組大小為1.00Gb，片段重疊群N50的長(zhǎng)度為 4.12Mb，被注釋到16796個(gè)蛋白編碼基因，其基因組的完整性為94.7%，整個(gè)基因組的重復(fù)序列是54.52%?？蒲腥藛T鑒定出三疣梭子蟹染色體為50對(duì)，裝配率為97.80%，Hi-C的N50為21.79Mb。這是一個(gè)高質(zhì)量、相當(dāng)完整的染色體水平基因組，也是蟹類研究中第一次通過(guò)分子生物學(xué)的方法精確地對(duì)蟹類染色體數(shù)目進(jìn)行鑒定。 三疣梭子蟹    唐伯平供圖中華絨螯蟹（Eriocheir japonica sinensis）俗稱河蟹，是世界上最重要的淡水經(jīng)濟(jì)蟹類，目前我國(guó)每年河蟹產(chǎn)量為80萬(wàn)噸左右。研究人員獲得的中華絨螯蟹基因組大小為1.27Gb，Contig序列N50為3.19Mb，且其GC含量為43%，高于其他節(jié)肢動(dòng)物。BUSCO評(píng)估其完整性為94.00%，重復(fù)序列在基因組中占61.42%，被功能注釋蛋白編碼基因22619個(gè)。 中華絨螯蟹   唐伯平供圖唐伯平團(tuán)隊(duì)對(duì)甲殼動(dòng)物中華絨螯蟹、三疣梭子蟹、凡納濱對(duì)蝦，昆蟲(chóng)埃及伊蚊、黑腹果蠅、偏瞳蔽眼蝶、蜘蛛等7種節(jié)肢動(dòng)物基因家系展開(kāi)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，它們共有15503個(gè)基因家系，其中8832個(gè)基因家系為共有家系，328個(gè)和544個(gè)基因家系分別唯一存在于三疣梭子蟹和中華絨螯蟹中。在這7種節(jié)肢動(dòng)物中，蝦蟹相對(duì)進(jìn)化速率最小，其中對(duì)蝦進(jìn)化速度最慢，其次是絨螯蟹和梭子蟹?！跋鄬?duì)于昆蟲(chóng)，蝦蟹類進(jìn)化較慢，可能是它們生活的環(huán)境相對(duì)于昆蟲(chóng)更加穩(wěn)定?！碧撇秸f(shuō)。 蝦蟹系統(tǒng)演化關(guān)系和相對(duì)進(jìn)化速率圖     唐伯平供圖另一個(gè)有趣的發(fā)現(xiàn)是，蝦蟹與昆蟲(chóng)的分化以及螃蟹和對(duì)蝦的分化幾乎是同時(shí)發(fā)生在4.3億年左右的志留紀(jì)。同屬于短尾類的中華絨螯蟹和三疣梭子蟹的分化時(shí)間則相對(duì)較晚，大約是在1.8億年前的侏羅紀(jì)。我國(guó)同時(shí)獲得1種海洋和1種淡水重要經(jīng)濟(jì)蟹類高質(zhì)量的基因組圖譜，將為蟹類和甲殼動(dòng)物的研究提供重要的理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐，同時(shí)也為經(jīng)濟(jì)蟹類育種、養(yǎng)殖和疾病防控工作提供重要的基礎(chǔ)平臺(tái)。相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giz161https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01340

研發(fā)階段/n該發(fā)明涉及人工構(gòu)建的偽狂犬病毒（pseudorabiesvirus，PrV）和豬細(xì)小病毒（porcineparvovirus，PPV）的主要結(jié)構(gòu)基因VP2。在缺失了主要毒力基因（TK）和病毒增殖非必需基因（gG）的偽狂犬病毒基因組中，定位插入豬細(xì)小病毒的VP2基因，使其位于偽狂犬病毒的強(qiáng)晚期啟動(dòng)子下游，插入的外源基因編碼的蛋白具有良好的免疫原性，可以刺激豬產(chǎn)生抵抗豬細(xì)小病毒和豬偽狂犬病毒兩種強(qiáng)毒攻擊的保護(hù)性免疫反應(yīng)。該發(fā)明還包括重組的偽狂犬病毒Pseudorabiesvirus，Hzau

研發(fā)階段/n可用于豬胴體性狀的遺傳改良，在豬的遺傳改良中胴體性狀的測(cè)定需要進(jìn)行屠宰測(cè)定，只有背膘厚度性狀可在達(dá)到目標(biāo)體重時(shí)進(jìn)行活體測(cè)定，利用這3項(xiàng)專利，可以進(jìn)行胴體性狀的改良（不需要進(jìn)行屠宰測(cè)定），降低背膘厚度，降低板油率和內(nèi)脂率，提高瘦肉率和腿臀肉骨率。

利用四通道連續(xù)噴墨打印機(jī)，結(jié)合鈣鈦礦成膜特性和原理，開(kāi)發(fā)了一種適用于混合鈣鈦礦薄膜制備的高通量連續(xù)噴墨打印技術(shù)。四種前驅(qū)體對(duì)應(yīng)四通道噴頭，每種噴頭可以打印一種成分，在同一玻璃基底上依次打印，通過(guò)控制每個(gè)噴頭的打印點(diǎn)進(jìn)而形成不同組分鈣鈦礦薄膜。整個(gè)打印過(guò)程可以通過(guò)系統(tǒng)軟件控制，實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)混合打印。打印的薄膜成品質(zhì)量高，能夠進(jìn)行物相、光學(xué)吸收和熒光強(qiáng)度

中試階段/n該項(xiàng)目所用的材料是牛皰疹病毒1型BHV-1臨床分離株，具有全部的毒力因子和其他免疫原性很好的抗原。因此，以該病毒為基礎(chǔ)構(gòu)建的牛傳染性鼻氣管炎ΔTK/ΔgE基因缺失標(biāo)志菌株所制備的基因工程疫苗對(duì)牛免疫具有很強(qiáng)的針對(duì)性，具有廣闊的市場(chǎng)應(yīng)用前景。

可以量產(chǎn)/n該研究通過(guò)定向基因缺失技術(shù)將牛傳染性鼻氣管炎病毒的毒力基因TK和必需基因gG缺失，得到了牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株。疫苗免疫是防制牛傳染性鼻氣管炎的根本措施，滅活疫苗不能區(qū)分野毒感染和疫苗免疫牛，弱毒疫苗有殘余毒力和返強(qiáng)風(fēng)險(xiǎn)，該研究獲得的牛傳染性鼻氣管炎的gG和TK雙基因缺失突變株，可區(qū)分野毒感染牛和疫苗免疫牛，是血清學(xué)“標(biāo)志”疫苗，為我國(guó)牛傳染性鼻氣管炎根除計(jì)劃提供了技術(shù)支撐。先進(jìn)性及主要技術(shù)指標(biāo)：（一）先進(jìn)性該研究是由我國(guó)自主研發(fā)，具有完全知識(shí)產(chǎn)權(quán)的牛